同居协议的法律效力需结合内容和法律规定判断：若双方自愿签订、内容不违反法律强制性规定或公序良俗（如不限制人身自由、不损害第三方权益），且采用书面形式，通常具有法律效力。例如，对同居期间共同财产分配、债务分担的约定，法院可能认可其效力。但涉及身份关系（如 “事实婚姻” 认定）或人身权利限制（如禁止交往自由）的条款无效，这类约定因违背法律强制规定而无法生效。

同居协议中关于财产、债务及子女抚养的合法约定可作为争议解决依据。例如，共同购置房产的出资比例约定、抚养费标准等，若内容明确且符合子女利益最大化原则，法院可能优先按协议处理。但需注意，协议若明显显失公平（如一方承担全部债务）或未充分保障子女权益，可能被法院调整。

签订同居协议时，建议明确财产归属、债务承担等具体事项，采用书面形式并签字，涉及重大财产可公证以增强证明力。复杂情形下，可委托律师审查协议合法性，避免因条款瑕疵导致无效。

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